南宁农工商集团有限责任公司的前身为南宁市农工商总公司，于1979年8月经广西壮族自治区人民政府批准成立，是南宁市人民政府领导下的行政性企业公司，行使南宁市农垦企业主管局的管理职能；1998年经南宁市人民政府批准，南宁市农工商总公司对原公司下属企业进行了公司制整体改造，组建集农业、工业、商业为一体的大型综合性企业集团—南宁农工商集团有限责任公司。
 
        2005年和2007年，农工商集团吸收合并了下属5个全资子公司，组建农工商集团总部。农工商集团总部设立北湖工业管理区、红星管理区、罗文管理区、东风管理区4个非独立核算的管理区及物业管理部、项目开发部2个专业部门。2013年11月，根据市委、市政府关于南宁市国资国企整合重组的有关精神，组建新的南宁农工商集团有限责任公司，定位为南宁市的农贸业投资平台，负责现代农业、农业基地建设等投资经营。目前，集团公司下设1个直属机构（红星管理区），7个全资子公司（南宁市金谷隆粮油购销有限责任公司、广西北湖工业投资有限责任公司、南宁市罗文实业有限责任公司、南宁市秀和物业服务有限责任公司、广西南宁华顺房地产有限责任公司、南宁市青龙岗长安墓园有限责任公司、南宁市柳沙企业有限责任公司），1个控股子公司（南宁农产品交易中心有限责任公司）。

        未来，农工商集团将以南宁农产品交易中心项目建设为契机，挖掘国资优势，整合内外资源，延伸上下游产业链，一二三产融合发展，构建南宁市农产品现代流通体系。重点发展农业投融资、农副产品流通贸易、仓储物流、加工配送及现代农业基地的投资经营等业务板块，力争到2020年，实现年营业收入10亿元，年利润总额4500万元，年上缴税金6000万元，资产总额达到80亿元，农工商成为广西行业龙头的现代农贸业集团。